É o mais longo rio totalmente incluído no território dos Estados Unidos, com aproximadamente 3,8 mil km de extensão. Ele tem seu inícoo na confluência dos rios Madison, Jefferson e Gallatin, no estado americano de Montana, e desemboca no rio Mississippi ao norte da cidade de St. Louis.
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O Rio Missouri é o maior em comprimento
totalmente situado em território norte americano
Sua bacia hidrográfica cobre cerca de um sexto de todo o continente norte-americano e, combinada com a bacia hidrográfica do rio Mississippi, forma a terceira maior do planeta, atrás apenas dos sistemas hidroviários dos rios Amazonas (América do Sul) e Nilo (África). Em seu curso original, o rio Missouri era o rio mais longo da América do Norte. No entanto, cerca de 300 km foram encurtados por canais e obras de irrigação.
O rio corta sete estados americanos (Montana, Dakota do Norte, Dakota do Sul, Nebraska, Iowa, Kansas e Missouri) antes de seu fim, na confluência com o rio Missouri, nos arrredores da cidade de St. Louis.